Tháng 7 năm 1972 trường cấp 3 Yên Định 2 chính thức được thành lập theo quyết định của chủ tịch UBHC Tỉnh Thanh Hóa (Số Số 565 TC/UBTH, ngày 25 tháng 7 năm 1972). Ngay sau khi được thành lập trường, năm học đầu tiên tuy chỉ có 28 thầy cô giáo và 578 học sinh nhưng vấn đề ổn định tổ chức, bộ máy hoạt động được nhà trường và chính quyền các cấp coi trọng; trong đó thành lập Chi bộ Đảng nhà trường là một trong những nhiệm vụ cấp bách đặt lên hàng đầu. Chính vì vậy, cùng với sự thành lập trường, Chi bộ trường Cấp 3 Yên Định 2 cũng được thành lập với những Đảng viên đầu tiên gồm các giáo viên từ các trường khác trong toàn huyện chuyển về. Số lượng Đảng viên khi mới thành lập còn rất ít. Cả Chi bộ có tổng 8 đảng viên, đồng chí Đỗ Ngọc Tạo làm Bí thư Chi bộ. Sự phát triển Đảng viên giai đoạn này cũng chậm do những tiêu chí kết nạp Đảng ngày ấy khá ngặt nghèo. Những ngày đầu xây dựng trường, đảng viên ít, mỗi đồng chí phải phụ trách nhiều phần việc đồng thời giai đoạn này Chi bộ trải qua bao vất vả, gian nan, dưới làn mưa bom, bão đạn ác liệt của đế quốc Mỹ với nhiều lần trường chuyển địa điểm nhưng nhờ có sự lao động cật lực của thầy, trò và sự ủng hộ, che chở của nhân dân địa phương về mọi mặt -  Nhà trường đều hoàn thành xuất sắc mọi nhiệm vụ: vừa dựng lán lớp, vừa đào hào, đắp lũy để đảm bảo an toàn cho thầy và trò trước những trận bắn phá điên cuồng của đế quốc Mỹ, vừa góp phần xây dựng và bảo vệ quê hương, đất nước.

Ngay sau ngày miền Nam được hoàn toàn giải phóng 30 tháng 4 năm 1975, Chi bộ Đảng nhà trường tiếp tục chỉ đạo xây dựng chiến lược mới với những khó khăn và thách thức mới. Vào những năm của thập niên 80, lúc này hoàn cảnh kinh tế rất khó khăn, nhà nước xóa bỏ bao cấp, đời sống cán bộ giáo viên nhân viên khá chật vật, chúng ta hẳn chưa quên những bữa ăn toàn mạch, sắn khô tự giã…Trong bộn bề khó khăn ấy, Chi bộ nhà trường đã thể hiện được vai trò lãnh đạo toàn diện, quyết tâm vượt qua chặng đường tưởng như không khắc phục nổi để tiến lên, thực hiện có hiệu quả phong trào thi đua “Dạy tốt - Học tốt”, phấn đấu hoàn thành mọi nhiệm vụ. Ngoài ra các thầy, cô giáo còn tham gia lao động trồng lúa, chăn nuôi, đóng gạch, vét mương, bốc than… gây quỹ để xây dựng cơ sở vật chất và ổn định đời sống cán bộ, giáo viên, nhân viên. Trong những năm đầu của thời kỳ đổi mới, sĩ số học sinh tăng nhanh. Cũng vào thời kỳ này, cơ sở vật chất của trường đã xuống cấp. Tường rào thấp, phòng học quá thời hạn đã dột nát, bàn ghế hư hỏng, học sinh phải ngồi xuống ghế xi măng. Ban giám hiệu, Chi bộ nhà trường lúc bấy giờ tiếp tục tham mưu với chính quyền các cấp để được đầu tư cơ sở vật chất.

       Năm 1994, Sau 13 năm đóng tại Yên Phong, nhờ sự tham mưu tích cực của cấp ủy Chi bộ và sự quan tâm của lãnh đạo UBND huyện, trường THPT Yên Định 2 được chuyển về địa điểm mới - Phố Kiểu, xã Yên Trường - trung tâm kinh tế, chính trị của các xã vùng Yên. Trong suốt thời gian này, cấp ủy chi bộ và BGH nhà trường đã đặc biệt quan tâm đến công tác cơ sở vật chất và công tác chất lượng giáo dục. Nhờ vậy, năm 1998 chi bộ đã tham mưu xây được 12 phòng học 2 tầng khang trang. Bộ mặt nhà trường đã có sự thay đổi thực sự, trường ra trường, lớp ra lớp đã tạo điều kiện cho phong trào thi đua dạy tốt học tốt. Năm 2001, 4 phòng học cấp 4 đúng qui cách ra đời và năm 2007 có thêm 12 phòng học 2 tầng nữa, năm 2008 xây dựng thêm 3 phòng bộ môn, trị giá 300 triệu đồng, 02 phòng vi tính với gần 50 máy phục vụ cho công tác dạy học, nâng cao chất lượng giáo dục toàn diện. Từ đây, học sinh được học ở các phòng học đủ tiêu chuẩn, có đầy đủ ánh sáng điện, có quạt mát, bàn ghế được đóng mới đảm bảo quy cách.

     Tháng 2/2013 căn cứ nhu cầu và tình hình thực tế của địa phương, tỉnh và huyện quyết định xác nhập trường THPT Bán công Hà Tông Huân sang trường Yên Định 2. Cũng từ đây, trường bước vào một giai đoạn phát triển mới, đội ngũ đảng viên đã phát triển hơn gắn liền với bề dày thành tích của nhà trường. Để tiếp tục phát huy cao nhất vai trò hạt nhân lãnh đạo trong điều kiện mới, Ban Thường vụ huyện Yên Định đã quyết định thành lập Đảng bộ trường THPT Yên Định 2 trực thuộc Đảng bộ Yên Định (Quyết định số 490-QĐ/HU ngày 26 tháng 6 năm 2013). Đây thực sự là một sự kiện chính trị quan trọng, đánh dấu một một thời kì phát triển mới, một chặng đường mới. Từ đó, đặt ra nhiều cơ hội mới, vận hội mới trong việc xây dựng nhà trường ngày càng phát triển. Sự ra đời của Đảng bộ Trường THPT Yên Định 2 đánh dấu bước ngoặt trọng đại đối với giáo viên và học sinh nhà trường.

Công tác chính trị tư tưởng luôn được Đảng bộ đặt ra ở vị trí quan trọng hàng đầu. Đảng bộ luôn lĩnh hội, phổ biến, triển khai kịp thời các văn bản chỉ đạo của cấp trên đến đoàn thể cán bộ, giáo viên và nhân viên của nhà trường để nghiêm túc thực hiện và từ thực tiễn của đơn vị mình mà có những sự vận dụng linh hoạt sáng tạo những văn bản ấy, định kì kiểm điểm, đánh giá, có biện pháp phát huy ưu điểm, khắc phục nhược điểm, khen thưởng kịp thời những đảng viên có thành tích tiêu biểu. Đặc biệt, trong những năm gần đây, việc học tập và triển khai chỉ thị 05 - CT/TW ngày 15/5/2016 của Bộ Chính trị về “Đẩy mạnh học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh” đã tạo sự chuyển biến tích cực trong nhận thức và hành động của cán bộ đảng viên, giáo viên và nhân viên trong nhà trường, đoàn kết nội bộ được nâng lên rõ rệt, tạo được sự đồng thuận cao trong cơ quan. Đảng ủy giữ mối quan hệ tốt với cấp ủy địa phương, đảng viên giữ mối liên hệ tốt với chi uỷ, đảng uỷ và gương mẫu thực hiện nghĩa vụ công dân nơi cư trú. Đảng bộ luôn xác định, để các hoạt động của nhà trường vận hành tốt nhất, phát huy tới mức cao nhất sức mạnh của trí tuệ tập thể sư phạm thì việc lãnh đạo xây dựng các tổ chức đoàn thể vững mạnh, hoạt động có nền nếp là một nhiệm vụ thường xuyên, liên tục của mình. Thực tiễn những năm qua đã chứng tỏ sự hoạt động của các tổ chức đoàn thể mà nổi bật là các hoạt động của Công đoàn và Đoàn Thanh niên cộng sản Hồ Chí Minh.

Công tác kiểm tra, giám sát được Đảng uỷ nhà trường cụ thể hóa bằng việc xây dựng cụ thể qui chế làm việc của Đảng uỷ, của UBKT, thường xuyên theo dõi, đôn đốc, kiểm tra tổ chức thực hiện, gắn nội dung kiểm tra, giám sát sát với hoạt động đặc thù của nhà trường, kết hợp tốt công tác kiểm tra giám sát định kì, thường xuyên và đột xuất để nắm bắt kịp thời diễn biến tình hình trong cán bộ Đảng viên, trên cơ sở đó có biện pháp giải quyết thích hợp.

 Đảng bộ đã xác định rõ nhiệm vụ hàng đầu là không ngừng nâng cao chất lượng giảng dạy trong giáo viên, thúc đẩy phong trào học tập trong học sinh. Xác định nhiệm vụ chỉ đạo công tác dạy và học là nhiệm vụ chính trị quan trọng nhất của nhà trường, Đảng bộ đã chú trọng đến sự phát triển đội ngũ nhà giáo và CBQL giáo dục, đảm bảo đủ về số lượng và cơ cấu bộ môn hợp lý. Ban chuyên môn tăng cường công tác giáo dục kĩ năng, nghiệp vụ sư phạm thông qua nhiều hình thức khác Ngoài ra, việc ứng dụng CNTT vào các hoạt động chỉ đạo, điều hành, giảng dạy được quan tâm, có nhiều giáo viên có giờ giảng sử dụng CNTT đã phát huy hiệu quả và được đánh giá cao.

      Với sự cố gắng vươn lên, trong nhiệm kỳ vừa qua Đảng bộ nhà trường đã đạt được nhiều thành tích đáng khích lệ

      + Tăng quy mô học sinh từ 28 đến 29 lớp/năm học, tỷ lệ học sinh có học lực yếu giảm dưới 5%, học sinh khá, giỏi đạt trên 70%, tỉ lệ học sinh đậu TN đạt bình quân hằng năm gần 98%. Số học sinh thi đậu vào ĐH, CĐ là 60% năm.

      + Trong các kì thi chọn học sinh giỏi các môn cấp tỉnh, nhà trường đã đạt được kết quả rất đáng khích lệ, luôn xếp tốp đầu trong cụm thi đua khối các trường THPT khu vực đồng bằng trung du và tốp 20 trường trong toàn tỉnh. Thi học sinh giỏi cấp tỉnh năm học 2017- 2018 nhà trường đứng thứ 18, năm học 2018- 2019 nhà trường tiếp tục tăng 2 bậc thứ hạng xếp loại và đứng thứ 16/106 trường THPT toàn tỉnh, năm học 2019-2020 Sở GD&ĐT Thanh Hóa không tổ chức thi học sinh giỏi do đại dịch Covid 19, năm học 2020-2021 nhà trường tiếp tục tăng 8 bậc thứ hạng xếp loại và đứng thứ 8/106 trường THPT toàn tỉnh, năm học 2021-2022 nhà trường xếp thứ 15/106 trường THPT toàn tỉnh.

       + Năm học 2014- 2015 trường có 2 em thi Đại học đạt thủ khoa Quốc gia (Em Nguyễn Văn Hinh thủ khoa trường học viện Quân y với số điểm 29,5 điểm; Em Trịnh Hữu Thanh Bình đạt thủ khoa trường Học viện hậu cần công an). Năm học 2015- 2016 trường có em Trịnh Văn Linh đạt giải KK Quốc gia trong kỳ thi giải toán bằng máy tính bộ môn vật lý. Năm học 2016- 2017 có em Trịnh Văn Thắng đạt 29,8 điểm đạt thủ khoa trường Học viện hậu cần quân đội. Em Nguyễn Tùng Dương là học sinh duy nhất toàn tỉnh tham gia thi Âm vang Xứ Thanh thi THPT QG đạt điểm 10 môn vật lý và đạt 27 điểm 3 môn khối A. Đặc biệt năm học 2018- 2019 thi Âm vang Xứ Thanh em Đỗ Công Hiếu đạt nhất quý và đạt giải nhì Âm vang Xứ Thanh chung kết Năm. 

Ngoài công tác trọng tâm, mũi nhọn, Đảng bộ nhà trường cũng hết sức quan tâm tới việc lãnh đạo hoạt động giáo dục toàn diện cho học sinh nhất là giáo dục về đạo đức lối sống và kỹ năng sống, về hoạt động tập thể, hoạt động phong trào, hoạt động xã hội; tăng cường ngoại ngữ và tin học… Với những chủ trương đúng đắn và giải pháp có hiệu quả, những năm qua, chất lượng của hoạt động mũi nhọn luôn được duy trì và phát triển trên nền tảng giáo dục toàn diện được nâng cao…

Dưới sự lãnh đạo của BCH Đảng bộ, Đảng bộ liên tục đạt trong sạch vững mạnh. Nhà trường liên tục được các cấp trên khen thưởng trong các năm học. Đã được nhà nước tặng Huân chương lao động hạng 3, Thủ Tướng Chính Phủ tặng bằng khen, Bằng khen của UBND tỉnh Thanh Hoá, Bằng khen của Bộ Giáo dục và đào tạo.

      Nhìn lại 50 năm qua, thành tích mà Đảng bộ được trong suốt 50 năm qua là rất đáng phấn khởi, là niềm tin của tất cả các thế hệ thầy, cô và học sinh nhà trường. Ra đời trong bom đạn, lớn lên trong đổi mới, trưởng thành trong hội nhập phát triển; nửa thế kỷ qua dưới ánh sáng nghị quyết của Đảng, với những đổi thay vươn tầm mạnh mẽ, Trường THPT Yên Định 2 luôn xứng danh là cái nôi của giáo dục huyện nhà, là lá cờ xuất sắc của giáo dục Thanh Hóa. Những truyền thống quý báu của Đảng bộ trong suốt 50 năm qua, là niềm vinh dự, tự hào đối với các thế hệ thầy trò trường THPT Yên Định 2 chúng ta. Nó đã và đang trở thành những con số biết nói, những dấu son lịch sử mà chúng ta có trách nhiệm giữ gìn và phát huy để Đảng bộ THPT Yên Định 2 luôn thành công, toả sáng mãi mãi.